Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT17Q9BSW7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms