Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CRBNQ96SW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms