Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q96MF0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q96MF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q96MF0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q96MF0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms