Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00615Q96LM1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00615Q96LM1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms