Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAGED4Q96JG8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MAGED4Q96JG8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms