Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RFT1Q96AA3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms