Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RGP1Q92546 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms