Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEF4Q8WZA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEF4Q8WZA2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms