Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHBDD1Q8TEB9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms