Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NGDNQ8NEJ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGDNQ8NEJ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms