Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00116Q8NCU8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00116Q8NCU8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms