Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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CLDN19Q8N6F1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLDN19Q8N6F1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms