Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC2Q8N158 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC2Q8N158 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms