Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms