Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms