Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YTHDF3Q7Z739 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms