Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC4Q7Z404 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms