Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms