Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CATSPER4Q7RTX7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms