Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BBS12Q6ZW61 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms