Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAXIP1Q6ZW49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms