Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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