Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC9Q6ZRR7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms