Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC141Q6ZP82 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms