Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms