Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MYOM3Q5VTT5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYOM3Q5VTT5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms