Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA76

LCE3A, Late cornified envelope protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3AQ5TA76 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LCE3AQ5TA76 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms