Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CELF3Q5SZQ8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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