Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms