Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P5Q59GN2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P5Q59GN2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms