Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q56UQ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q56UQ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms