Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms