Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWISTNBQ3B726 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms