Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC142Q17RM4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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