Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM187BQ17R55 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM187BQ17R55 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms