Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA2Q15822 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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