Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOMM20Q15388 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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