Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTF1Q15361 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTF1Q15361 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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