Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCOLCEQ15113 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCOLCEQ15113 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms