Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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