Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
R3HDM1Q15032 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HDM1Q15032 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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