Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
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