Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM25Q14258 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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