Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARF1Q14162 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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