Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNGB1Q14028 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB1Q14028 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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