Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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