Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP1A4Q13733 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms