Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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PKD2Q13563 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKD2Q13563 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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