Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATRQ13535 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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