Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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FOXE3Q13461 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXE3Q13461 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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